ช่วงนี้เข้าสู่ฤดูฝนแล้ว ฝนตกบ่อยอากาศมีความชื้นมาก หากแป้งพิซซ่าถูกไอฝนหรือความชื้นจะทำให้เกิดเชื้อราได้ง่าย

ควรเก็บแป้งพิซซ่าไว้ในที่แห้งวางกระจายกันไว้ไม่ให้ร้อนอบอ้าว จัดเก็บแป้งพิซซ่าไว้ในตู้เย็นจะดีที่สุด เวลาจะใช้งานก็นำออกมาแต่พอขายในวันนั้น เพราะแป้งที่นำออกจากตู้เย็นจะเกิดราได้ง่าย ไม่ควรเอาออกมามากจนเกินไป กะให้พอดีแต่ละวัน

ถ้าต้องการเก็บแป้งพิซซ่าไว้นานหลายสัปดาห์หรือหลายเดือนให้แช่ในช่องแข็งของตู้เย็นหรือตู้แช่แข็ง แต่ห้ามแช่ในถังน้ำแข็ง เวลาจะใช้งานก็นำออกมาเตรียมไว้ล่วงหน้าสัก1ชั่วโมงให้แป้งหายเย็นก่อน โดยขณะนำแป้งพิซซ่าออกมาให้ปัดเกร็ดน้ำแข็งที่อาจเกาะตามแป้งออกก่อนที่จะละลายเป็นน้ำ